MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 10158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008526	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008526	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008526	AAAC	2	8	1453	1460	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008526	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008526	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008526	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008526	AT	4	8	1573	1580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008526	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008526	T	7	7	2790	2796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008526	ATGAA	2	10	2813	2822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008526	AGC	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008526	T	6	6	2881	2886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008526	T	6	6	2913	2918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008526	TGA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008526	TTG	2	6	2958	2963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008526	T	6	6	2988	2993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008526	AAT	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008526	AGT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008526	TAAT	2	8	3240	3247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008526	GAC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008526	TGA	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008526	AGG	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008526	GAG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008526	TAA	2	6	9544	9549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008526	TTTG	2	8	9625	9632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008526	TCC	2	6	10357	10362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008526	GCAA	2	8	10441	10448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008526	AGA	2	6	10455	10460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008526	TGC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008526	AGG	2	6	10519	10524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008526	CGC	2	6	10975	10980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008526	AGG	2	6	11077	11082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008526	T	6	6	11396	11401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008526	GGA	2	6	12090	12095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008526	T	7	7	12382	12388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008526	GTA	2	6	12411	12416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008526	TGA	2	6	12442	12447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008526	CG	3	6	12502	12507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008526	ATG	2	6	12510	12515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008526	AGA	2	6	12557	12562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008526	AAAT	2	8	12607	12614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008526	TA	3	6	12694	12699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008526	ATT	2	6	12754	12759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008526	GCG	3	9	15270	15278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008526	AAG	2	6	15281	15286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008526	TTA	2	6	15536	15541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008526	TG	3	6	15542	15547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008526	T	6	6	15560	15565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008526	GA	3	6	15616	15621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008526	ATT	2	6	15691	15696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008526	ACG	2	6	15781	15786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008526	T	6	6	15795	15800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008526	ATA	2	6	15889	15894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008526	TTTTA	2	10	16553	16562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008526	TCT	2	6	16586	16591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008526	A	6	6	16634	16639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008526	CGG	2	6	16662	16667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008526	TAC	2	6	17347	17352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008526	TGTT	2	8	17353	17360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008526	GAA	2	6	17396	17401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008526	AAGC	2	8	17412	17419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008526	A	6	6	17447	17452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008526	TC	3	6	17459	17464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008526	A	6	6	17473	17478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008526	CAT	2	6	17485	17490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008526	TTG	2	6	17491	17496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008526	GCA	3	9	17506	17514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008526	TAA	2	6	17557	17562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008526	TG	3	6	17563	17568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008526	AAC	2	6	17619	17624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008526	ATT	2	6	17678	17683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008526	GACT	2	8	17710	17717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008526	TCA	2	6	17776	17781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008526	A	7	7	17781	17787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008526	AAAC	2	8	17796	17803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008526	A	6	6	17833	17838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008526	TCA	2	6	17847	17852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008526	TAA	2	6	17866	17871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008526	AAG	2	6	17895	17900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008526	CCG	2	6	17937	17942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008526	A	6	6	17945	17950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008526	A	6	6	17998	18003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008526	AG	3	6	18050	18055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008526	CGC	2	6	18137	18142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008526	TAT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008526	ACC	2	6	19015	19020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008526	GT	3	6	19061	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008526	AGC	2	6	19076	19081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008526	TAAT	2	8	19234	19241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008526	AT	3	6	19240	19245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008526	AC	3	6	19284	19289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008526	TTG	2	6	19698	19703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008526	CAA	2	6	19718	19723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008526	TGC	2	6	19746	19751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008526	ACAG	2	8	19761	19768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008526	CAG	3	9	19766	19774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008526	CCT	2	6	19915	19920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008526	A	7	7	19929	19935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008526	CTT	2	6	19972	19977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008526	AAGA	2	8	19999	20006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008526	TGA	2	6	20054	20059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008526	TCTGG	2	10	20102	20111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008526	GTGAT	2	10	20134	20143	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008526	GGTA	2	8	20161	20168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008526	TGA	2	6	21508	21513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008526	A	6	6	21524	21529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008526	GAC	2	6	21540	21545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008526	CCT	2	6	24860	24865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008526	TG	3	6	24884	24889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008526	GTTTT	2	10	25101	25110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008526	ATG	2	6	25131	25136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008526	GGA	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008526	ATA	2	6	25727	25732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008526	CTC	2	6	27712	27717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008526	GT	3	6	27760	27765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008526	T	7	7	27798	27804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008526	GAA	2	6	27872	27877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008526	AAT	2	6	28496	28501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008526	TTCTT	2	10	28522	28531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008526	ATGA	2	8	28536	28543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008526	CAA	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008526	AAGC	2	8	30302	30309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008526	CA	3	6	30417	30422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008526	AGCA	2	8	31808	31815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008526	ATTT	2	8	31856	31863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008526	TCA	2	6	31882	31887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008526	TA	3	6	31934	31939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008526	AG	3	6	32381	32386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008526	CAA	2	6	32900	32905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008526	CAT	2	6	32988	32993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008526	AAG	2	6	34520	34525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008526	A	7	7	34535	34541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008526	TCA	2	6	34569	34574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008526	AGAA	2	8	34626	34633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008526	AAT	2	6	35328	35333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008526	A	6	6	35374	35379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008526	CTT	2	6	35412	35417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008526	TGA	2	6	35463	35468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008526	ACG	2	6	36769	36774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008526	TTG	2	6	36780	36785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008526	TAGT	2	8	36815	36822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008526	GGA	2	6	36856	36861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008526	ACC	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008526	A	6	6	36905	36910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008526	AG	3	6	36957	36962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008526	CGC	2	6	37044	37049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_008526	TAT	2	6	37119	37124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008526	TAT	2	6	37900	37905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008526	TAA	2	6	37943	37948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008526	TAGT	2	8	38003	38010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008526	GA	3	6	38024	38029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008526	TGT	2	6	38036	38041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008526	CTG	2	6	38291	38296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_008526	GAA	2	6	38308	38313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008526	TAT	2	6	38681	38686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008526	A	6	6	38707	38712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008526	T	6	6	38791	38796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008526	CAA	2	6	38871	38876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_008526	TGT	2	6	39474	39479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008526	CAA	2	6	39583	39588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008526	A	7	7	39664	39670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008526	CAA	2	6	41658	41663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_008526	GTA	2	6	41684	41689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008526	ATAG	2	8	41752	41759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008526	AAT	2	6	41779	41784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_008526	TC	3	6	42722	42727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_008526	CCT	2	6	42929	42934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_008526	CGAAC	2	10	42948	42957	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_008526	ATT	2	6	43011	43016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008526	ACAT	2	8	43044	43051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_008526	TTA	2	6	43079	43084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_008526	T	8	8	43143	43150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_008526	ATAAA	2	10	44234	44243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008526	TAT	2	6	44702	44707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008526	CAA	2	6	44730	44735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_008526	TCA	2	6	44800	44805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_008526	T	6	6	44833	44838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008526	CA	3	6	44909	44914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_008526	AATC	2	8	44928	44935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_008526	CAA	2	6	45149	45154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_008526	ATG	2	6	45185	45190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_008526	GGA	2	6	67934	67939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_008526	T	6	6	69307	69312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_008526	AAG	2	6	69382	69387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008526	ATAA	2	8	69394	69401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008526	T	6	6	69440	69445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008526	TCAA	2	8	69469	69476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
288	NC_008526	AGAC	2	8	69511	69518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
289	NC_008526	AG	4	8	69528	69535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008526	TTC	2	6	69552	69557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_008526	CAT	2	6	119479	119484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_008526	CGT	2	6	119549	119554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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